RNA的斑點雜交--樣本RNA點膜
一、試劑與儀器
1. 20×SSC(標準檸檬酸鹽緩沖液)(pH 7.0)
NaCl 175.3g
檸檬酸鈉 88.2g
加H2 O至 1000ml
用10N NaOH or 10N HCl調pH至7.0,高壓滅菌。
2. 37%甲醛
3. 甲酰胺
4. 2×Denhardt液
5. 硝酸纖維素膜
6. 多孔過濾加樣器和真空泵
7. 恒溫水浴搖床
8. 加樣器和吸頭等
二、操作步驟
1. 樣本RNA變性:
20 μl RNA溶液(2μgRNA)
4 μl 20×SSC
14 μl 37%甲醛
40 μl 100%甲酰胺
將上述溶液均勻,置60℃溫育30 min,冰浴冷卻樣品,使樣本RNA變性。在上述RNA液體中每100 ul液中加210 ul 20×SSC(共310 ul),作為點樣溶液,點樣時每孔加150 ul。
2. 纖維素膜處理:硝酸纖維素膜(0.45 um)水中浸泡5 min,再用20×SSC室溫浸泡1h。
3. 濾器的處理及點樣:用0.1 M NaOH浸泡(洗)多孔過濾加樣器,再用滅菌水徹底沖洗。將纖維素膜壓在多孔加樣器的上層板的上面,再壓在下層板上,趕去氣泡,然后兩部分夾緊,點樣前,先用20×SSC(200 μl)洗一遍每個孔,真空抽吸干凈后,再分別點樣。
如有未點樣孔須用150 ul 的20×SSC封住其孔,然后用真空泵抽吸干凈,再用20×SSC清洗一次,待流體濾過纖維膜后,繼續抽吸5 min 以干燥濾膜。
4. 取出膜,80℃烤2~3 h,膜保存于-20℃。