EB（Ethidium bromide，溴化乙錠）
溴化乙錠是一種高度靈敏的熒光染色劑，用于觀察瓊脂糖和聚丙烯酰胺凝膠中的DNA。溴化乙錠用標準302nm 紫外光透射儀激發并放射出橙紅色信號，可用Polaroid 底片或帶CCD 成像頭的凝膠成像處理系統拍攝。
觀察瓊脂糖凝膠中DNA最常用的方法是利用熒光染料溴化乙錠進行染色，溴化乙錠含有一個可以嵌入DNA堆積堿基之間的一個三環平面基團。它與DNA的結合幾乎沒有堿基序列特異性。在高離子強度的飽和溶液中，大約每2.5個堿基插入一個溴化乙錠分子。
當染料分子插入后，其平面基團與螺旋的軸線垂直并通過范德華力與上下堿基相互作用。這個基團的固定位置及其與堿基的密切接近，導致與DNA結合的染料呈現熒光，其熒光產率比游離溶液中染料有所增加。DNA吸收254nm處的紫外輻射并傳遞給染料，而被結合的染料本身吸收302nm和366nm的光輻射。
這兩種情況下，被吸收的能量在可見光譜紅橙區的590nm處重新發射出來。由于溴化乙錠-DNA復合物的熒光產率比沒有結合DNA的染料高出20-30倍，所以當凝膠中含有游離的溴化乙錠（0.5ug/ml）時，可以檢測到少至10ng的DNA條帶。
溴化乙錠可以用來檢測單鏈或雙鏈核酸（DNA或RNA）。但是染料對單鏈核酸的親和力相對較小，所以其熒光產率也相對較低。事實上，大多數對單鏈DNA或RNA染色的熒光時通過染料結合到分子內形成較短的鏈內螺旋產生的。
盡管在該染料存在的情況下，線狀DNA的電泳遷移率約降低15%，因此，當需要知道DNA片段的準確大小（如DNA限制酶酶切圖譜的鑒定），凝膠應該在無EB情況下電泳，電泳結束后用EB染色。染色完畢后，通常不需要脫色。但是在檢測小量DNA（小于10ng）片段時，通常要將染色后的凝膠進行脫色。
一、溴化乙錠的損害
溴化乙錠可以嵌入堿基分子中，導致錯配。溴化乙錠是強誘變劑，具有高致癌性！
SYBR Green I 和溴化乙啶（EB）Ames 測試結果顯示EB容易引起有機體突變。(Singer et al., Mutat. Res. 199, 439: 37- 47.)
溴化乙錠溶液的凈化處理
由于溴化乙錠具有一定的毒性，實驗結束后，應對含EB的溶液進行凈化處理再行棄置，以避免污染環境和危害人體健康。
(1) 對于EB含量大于0.5mg/ml的溶液，可如下處理：
①將EB溶液用水稀釋至濃度低于0.5mg/ml；
②加入一倍體積的0.5mol/L KMnO4，混勻，再加入等量的2.5mol/L HCl，混勻，置室溫數小時；
③加入一倍體積的2.5mol/L NaOH，混勻并廢棄。
(2) EB含量小于0.5mg/ml的溶液可如下處理：
① 按1mg/ml的量加入活性炭，不時輕搖混勻，室溫放置1小時；
② 用濾紙過濾并將活性碳與濾紙密封后丟棄。
CTAB緩沖液（DNA提取液）
十六烷基三甲基溴化銨 別稱:西曲溴銨、溴棕三甲基銨、溴烷銨，鯨熔三甲基溴化銨；CTAB；CTMAB；HTAB；CTABr；陽性皂
英文名 Hexadecyl trimethyl ammonium Bromide；Cetrimonium Bromide
分類 季銨鹽
代碼 A－15 CAS號 57-09-0 EINECS 登錄號 200-311-3
分子式 C16H33(CH3)3NBr
分子量 364.446
熔點：250-237℃ 水溶性 13 g/L (20°C) 純度(含量) ＞99%
二、物理化學性質
本品呈白色或淺黃色結晶體至粉末狀，有刺激氣味，易溶于異丙醇，可溶于水,震蕩時產生大量泡沫，能與陽離子、非離子、兩性表面活性劑有良好的配伍性。具有優良的滲透、柔化、乳化、抗靜電、生物降解性及殺菌等性能。本品化學穩定性好，耐熱、耐光、耐壓、耐強酸強堿。
用途 本品為天然、合成橡膠、硅油和瀝青乳化劑；合成纖維、天然纖維和玻璃纖維的抗靜電劑、柔軟劑；護發素的調理劑；相轉移催化劑；乳液起泡劑、表面活性劑，分析試劑，滌綸真絲化劑，皮革加脂劑，它還用于助焊劑、焊錫膏生產里起表面活性劑作用，活性強，對亮點、虛焊、焊電飽滿都有一定作用。
HLB值15.8,熔于熱水、乙醇、三氯甲烷,易熔于異丙醇水溶液,微溶于丙酮,不溶于醚。有良好的表面活性、穩定性、殺菌性及生物降解性。在強酸及強堿中穏定,耐熱、耐光。與非離子及兩性離子表面活性劑有良好的配伍性,對多種油脂具較好的乳化作用.對皮膚及粘膜刺激性小,有輕微脫脂作用。
是一種陽離子去污劑，廣泛用于潤濕、殺菌、抗靜電、去污、增溶等方面。可用作纖維高效抗靜電劑。工業及油田水處理中用作殺菌滅藻劑、粘泥剝離劑。牙膏中用作口腔殺菌劑。用于香波及護發素,可使頭發易于梳理、光滑、柔軟。
還右用作礦物浮選劑、電鍍液緩蝕劑、瀝青乳化劑、硬表面清洗劑及有機合成相轉移催化劑等。還具有從低離子強度的溶液中沉淀核酸和酸性多聚糖的特性，在這種條件下，蛋白質和中性多聚糖仍留在溶液里，在高離子強度的溶液里，CTAB與蛋白質和大多數酸性多聚糖以外的多聚糖形成復合物，只是不能沉淀核酸。
因此，CTAB可以用于從大量產生粘多糖的有機體如植物以及某些革蘭氏陰性菌（包括E.coli的某些株）中制備純化DNA 。
三、重要用途
提取DNA配方
CTAB為十六烷基三甲基溴化銨，
CTAB提取緩沖液的經典配方
Tris-HCl (pH8.0)提供一個緩沖環境,防止核酸被破壞；
EDTA螯合Mg2+或Mn2+離子,抑制DNase活性；
NaCl 提供一個高鹽環境,使DNP充分溶解,存在于液相中；
Cβ-巰基乙醇是抗氧化劑,有效地防止酚氧化成醌,避免褐變,使酚容易去除基因組DNA。
CTAB 4g
NaCl 16.364 g
1M Tris-HCl 20ml( PH8.0)
0.5M EDTA 8ml，先用70ml ddH2O溶解, 再定容至200ml滅菌
冷卻后0.2-1% 2-巰基乙醇（400ul）氯仿-異戊醇（24：1）：先加96ml氯仿，再加4ml異戊醇，搖勻即可。
提取RNA配方
2% CTAB（W/V）
2% 聚乙烯吡咯烷酮PVP（W/V）
100 mM Tris-HCl（pH8.0,DEPC處理的水配置）
25mM EDTA
0.5g/L 亞精胺Spermidine
2.0M NaCl，2%巰基乙醇（V/V，使用前加入）
由于在高溫滅菌條件下，Tris-HCl要和DEPC發生反應，所以配RNA提取緩沖液時直接用DEPC 處理的水配制即可。
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