凝膠層析(分子排阻層析)的種類、操作及應(yīng)用
相關(guān)專題
凝膠層析是一種利用被分離蛋白質(zhì)分子量的差異進(jìn)行分離的層析技術(shù) ,又名凝膠過濾或分子篩層析或分子排阻層析。分子排阻層析最大的優(yōu)勢(shì)在于實(shí)驗(yàn)所需條件極其溫和。
凝膠層析簡(jiǎn)介
凝膠層析(gel chromatography)又稱為凝膠排阻層析(gel exclusion chromatography)、分子 篩層析(molecular sieve chromatography)、凝膠過濾(gel filtration)、凝膠滲透層析(gel permeation chromatography)等。它是以多孔性凝膠填料為固定相,按分子大小順序分離樣品中各個(gè)組分的液相色譜方法。
1959年,Porath和Flodin首次用一種多孔聚合物-交聯(lián)葡聚糖凝膠作為柱填料,分離水溶液中不同分子量的樣品,稱為凝膠過濾。
1964年,Moore制備了具有不同孔徑的交聯(lián)聚苯乙烯凝膠,能夠進(jìn)行有機(jī)溶劑中的分離,稱為凝膠滲透層析(流動(dòng)相為有機(jī)溶劑的凝膠層析一般稱為凝膠滲透層析)。隨后這一技術(shù)得到不斷的完善和發(fā)展,目前廣泛的應(yīng)用于生物化學(xué)、高分子化學(xué)等很多領(lǐng)域。
凝膠層析是生物化學(xué)中一種常用的分離手段,它具有設(shè)備簡(jiǎn)單、操作方便、樣品回收率高、實(shí)驗(yàn)重復(fù)性好、特別是不改變樣品生物學(xué)活性等優(yōu)點(diǎn),因此廣泛用于蛋白質(zhì)(包括酶)、核酸、多糖等生物分子 的分離純化,同時(shí)還應(yīng)用于蛋白質(zhì)分子量的測(cè)定、脫鹽、樣品濃縮等。
凝膠層析的基本原理
凝膠層析是依據(jù)分子大小這一物理性質(zhì)進(jìn)行分離純化的。凝膠層析的固定相是惰性的珠狀凝膠顆粒,凝膠顆粒的內(nèi)部具有立體網(wǎng)狀結(jié)構(gòu),形成很多孔穴。當(dāng)含有不同分子大小的組分的樣品進(jìn)入凝膠層析柱 后,各個(gè)組分就向固定相的孔穴內(nèi)擴(kuò)散,組分的擴(kuò)散程度取決于孔穴的大小和組分分子大小。
比孔穴孔徑大的分子不能擴(kuò)散到孔穴內(nèi)部,完全被排阻在孔外,只能在凝膠顆粒外的空間隨流動(dòng)相向下流動(dòng),它們經(jīng)歷的流程短,流動(dòng)速度快,所以首先流出;而較小的分子則可以完全滲透進(jìn)入凝膠顆粒內(nèi)部,經(jīng)歷的流程長(zhǎng),流動(dòng)速度慢,所以最后流出;而分子大小介于二者之間的分子在流動(dòng)中部分滲透。
滲透的程度取決于它們分子的大小,所以它們流出的時(shí)間介于二者之間,分子越大的組分越先流出,分子越小的組分越后流出。這樣樣品經(jīng)過凝膠層析后,各個(gè)組分便按分子從大到小的順序依次流出,從而達(dá)到了分離的目的。
1、外水體積、內(nèi)水體積、基質(zhì)體積、柱床體積、洗脫體積
外水體積是指凝膠柱中凝膠顆粒周圍空間的體積,也就是凝膠顆粒間液體流動(dòng)相的體積。內(nèi)水體積是指凝膠顆粒中孔穴的體積,凝膠層析中固定相體積就是指內(nèi)水體積。基質(zhì)體積是指凝膠顆粒實(shí)際骨架體積。而柱床體積就是指凝膠柱所能容納的總體積。
洗脫體積是指將樣品中某一組分洗脫下來所需洗脫液的體積。我們?cè)O(shè)柱床體積為Vt,外水體積為Vo,內(nèi)水體積為Vi,基質(zhì)體積為Vg,則有:
Vt=Vo+Vi+Vg
由于Vg相對(duì)很小,可以忽略不計(jì),則有:
Vt=Vo+Vi
設(shè)洗脫體積為Ve,Ve一般是介于Vo 和Vt之間的。對(duì)于完全排阻的大分子,由于其不進(jìn)入凝膠顆粒內(nèi)部,而只存在于流動(dòng)相中,故其洗脫體積Ve=Vo;對(duì)于完全滲透的小分子 ,由于它可以存在于凝膠柱整個(gè)體積內(nèi)(忽略凝膠本身體積Vg),故其洗脫體積Ve=Vt。
分子量介于二者之間的分子,它們的洗脫體積也介于二者之間。有時(shí)可能會(huì)出現(xiàn)Ve ? Vt,這是由于這種分子與凝膠有吸附作用造成的。
柱床體積Vt可以通過加入一定量的水至層析柱預(yù)定標(biāo)記處,然后測(cè)量水的體積來測(cè)定。外水體積Vo可以通過測(cè)定完全排阻的大分子物質(zhì)的洗脫體積來測(cè)定,一般常用藍(lán)色葡聚糖-2000作為測(cè)定外水體積的物質(zhì)。因?yàn)樗姆肿恿看?為200萬(wàn)),在各種型號(hào)的凝膠中都被排阻,并且它呈藍(lán)色,易于觀察和檢測(cè)。
2、分配系數(shù)
分配系數(shù)是指某個(gè)組分在固定相和流動(dòng)相中的濃度比。對(duì)于凝膠層析,分配系數(shù)實(shí)質(zhì)上表示某個(gè)組分在內(nèi)水體積和在外水體積中的濃度分配關(guān)系。
3、排阻極限
排阻極限是指不能進(jìn)入凝膠顆粒孔穴內(nèi)部的最小分子的分子量。所有大于排阻極限的分子都不能進(jìn)入凝膠顆粒內(nèi)部,直接從凝膠顆粒外流出,所以它們同時(shí)被最先洗脫出來。
排阻極限代表一種凝膠能有效分離的最大分子量,大于這種凝膠的排阻極限的分子用這種凝膠不能得到分離。例如Sephadex G-50的排阻極限為30,000,它表示分子量大于30,000的分子都將直接從凝膠顆粒之外被洗脫出來。
4、分級(jí)分離范圍
分級(jí)分離范圍表示一種凝膠適用的分離范圍,對(duì)于分子量在這個(gè)范圍內(nèi)的分子,用這種凝膠可以得到較好的線性分離。例如Sephadex G-75對(duì)球形蛋白的分級(jí)分離范圍為3,000-70,000,它表示分子量在這個(gè)范圍內(nèi)的球形蛋白可以通過Sephadex G-75得到較好的分離。應(yīng)注意,對(duì)于同一型號(hào)的凝膠,球形蛋白與線形蛋白的分級(jí)分離范圍是不同的。
5、吸水率和床體積
吸水率是指1g干的凝膠吸收水的體積或者重量,但它不包括顆粒間吸附的水份。所以它不能表示凝膠裝柱后的體積。而床體積是指1g干的凝膠吸水后的最終體積。
6、凝膠顆粒大小
層析用的凝膠一般都成球形,顆粒的大小通常以目數(shù)(mesh)或者顆粒直徑(m)來表示。柱子的分辨率和流速都與凝膠顆粒大小有關(guān)。顆粒大,流速快,但分離效果差;顆粒小,分離效果較好,但流速慢。一般比較常用的是100-200目。
凝膠的種類和性質(zhì)
凝膠的種類很多,常用的凝膠主要有葡聚糖凝膠(dextran)、聚丙烯酰胺凝膠(polyacrylamide)、瓊脂糖凝膠(agarose)以及聚丙烯酰胺和瓊脂糖之間的交聯(lián)物。另外還有多孔玻璃珠、多孔硅膠、聚苯乙烯凝膠等等。下面將分別介紹。
1、葡聚糖凝膠
葡聚糖凝膠是指由天然高分子-葡聚糖與其它交聯(lián)劑交聯(lián)而成的凝膠。葡聚糖凝膠主要由Pharmacia Biotech生產(chǎn)。常見的有兩大類,商品名分別為Sephadex和Sephacryl。
葡聚糖凝膠中最常見的是Sephadex系列,它是葡聚糖與3-氯-1,2環(huán)氧丙烷(交聯(lián)劑)相互交聯(lián)而成,交聯(lián)度由環(huán)氧氯丙烷的百分比控制。Sephadex 的主要型號(hào)是G-10 ? G-200,后面的數(shù)字是凝膠的吸水率(單位是ml / g干膠)乘以10。如Sephadex G-50,表示吸水率是5ml/g干膠。
Sephadex的親水性很好,在水中極易膨脹,不同型號(hào)的Sephadex的吸水率不同,它們的孔穴大小和分離范圍也不同。數(shù)字越大的,排阻極限越大,分離范圍也越大。Sephadex中排阻極限最大的G-200為6?105。
Sephadex在水溶液、鹽溶液、堿溶液、弱酸溶液以及有機(jī)溶液中都是比較穩(wěn)定的,可以多次重復(fù)使用。Sephadex穩(wěn)定工作的pH一般為為2-10。強(qiáng)酸溶液和氧化劑會(huì)使交聯(lián)的糖苷鍵水解斷裂,所以要避免Sephadex與強(qiáng)酸和氧化劑接觸。
Sephadex在高溫下穩(wěn)定,可以煮沸消毒,在100 ?C下40 min對(duì)凝膠的結(jié)構(gòu)和性能都沒有明顯的影響。Sephadex由于含有羥基基團(tuán),故呈弱酸性,這使得它有可能與分離物中的一些帶電基團(tuán)(尤其是堿性蛋白)發(fā)生吸附作用。
但一般在離子強(qiáng)度大于0.05的條件下,幾乎沒有吸附作用。所以在用Sephadex進(jìn)行凝膠層析實(shí)驗(yàn)時(shí)常使用一定濃度的鹽溶液作為洗脫液,這樣就可以避免Sephadex與蛋白發(fā)生吸附,但應(yīng)注意如果鹽濃度過高,會(huì)引起凝膠柱床體積發(fā)生較大的變化。
Sephadex有各種顆粒大小(一般有粗、中、細(xì)、超細(xì))可以選擇,一般粗顆粒流速快,但分辨率較差;細(xì)顆粒流速慢,但分辨率高。要根據(jù)分離要求來選擇顆粒大小。Sephadex的機(jī)械穩(wěn)定性相對(duì)較差,它不耐壓,分辨率高的細(xì)顆粒要求流速較慢,所以不能實(shí)現(xiàn)快速而高效的分離。
另外,Sephadex G-25和G-50中分別加入羥丙基基團(tuán)反應(yīng),形成LH型烷基化葡聚糖凝膠,主要型號(hào)為Sephadex LH-20和LH-60,適用于以有機(jī)溶劑為流動(dòng)相,分離脂溶性物質(zhì),例如膽固醇、脂肪酸激素等。
Sephacryl是葡聚糖與甲叉雙丙烯酰胺(N, N’-methylenebisacrylamide)交聯(lián)而成。是一種比較新型的葡聚糖凝膠。Sephacryl的優(yōu)點(diǎn)就是它的分離范圍很大,排阻極限甚至可以達(dá)到108,遠(yuǎn)遠(yuǎn)大于Sephadex的范圍。所以它不僅可以用于分離一般蛋白,也可以用于分離蛋白多糖、質(zhì)粒、甚至較大的病毒顆粒。
Sephacryl與Sephadex相比另一個(gè)優(yōu)點(diǎn)就是它的化學(xué)和機(jī)械穩(wěn)定性更高:Sephacryl在各種溶劑中很少發(fā)生溶解或降解,可以用各種去污劑、胍、脲等作為洗脫液,耐高溫,Sephacryl穩(wěn)定工作的pH一般為3~11。
另外Sephacryl的機(jī)械性能較好,可以以較高的流速洗脫,比較耐壓,分辨率也較高,所以Sephacryl相比Sephadex可以實(shí)現(xiàn)相對(duì)比較快速而且較高分辨率的分離。
2、聚丙烯酰胺凝膠
聚丙烯酰胺凝膠是丙烯酰胺(acrylamide)與甲叉雙丙烯酰胺交聯(lián)而成。改變丙烯酰胺的濃度,就可以得到不同交聯(lián)度的產(chǎn)物。聚丙烯酰胺凝膠主要由Bio-Rad Laboratories生產(chǎn),商品名為Bio-Gel P,主要型號(hào)有Bio-Gel P-2 ? Bio-Gel P-300等10種,后面的數(shù)字基本代表它們的排阻極限的10-3,所以數(shù)字越大,可分離的分子量也就越大。各種型號(hào)的主要參數(shù)如附表所示。
聚丙烯酰胺凝膠的分離范圍、吸水率等性能基本近似于Sephadex。排阻極限最大的Bio-Gel P-300為4?105。聚丙烯酰胺凝膠在水溶液、一般的有機(jī)溶液、鹽溶液中都比較穩(wěn)定。聚丙烯酰胺凝膠在酸中的穩(wěn)定性較好,在pH為1~10之間比較穩(wěn)定。
但在較強(qiáng)的堿性條件下或較高的溫度下,聚丙烯酰胺凝膠易發(fā)生分解。聚丙烯酰胺凝膠非常親水,基本不帶電荷,所以吸附效應(yīng)較小。另外,聚丙烯酰胺凝膠不會(huì)象葡聚糖凝膠和瓊脂糖凝膠那樣可能生長(zhǎng)微生物。聚丙烯酰胺凝膠對(duì)芳香族、酸性、堿性化合物可能略有吸附作用,使用離子強(qiáng)度略高的洗脫液就可以避免。
3、瓊脂糖凝膠
瓊脂糖是從瓊脂中分離出來的天然線性多糖,它是瓊脂去掉其中帶電荷的瓊脂膠得到的。瓊脂糖是由D-半乳糖(D-galactose)和3,6-脫水半乳糖(anhydrogalactose)交替構(gòu)成的多糖鏈。它在100 ?C時(shí)呈液態(tài),當(dāng)溫度降至45 ?C以下時(shí),多糖鏈以氫鍵方式相互連接形成雙鏈單環(huán)的瓊脂糖,經(jīng)凝聚即成為束狀的瓊脂糖凝膠。
瓊脂糖凝膠的商品名因生產(chǎn)廠家不同而異,常見的主要有Pharmacia Biotech生產(chǎn)的Sepharose(2B ? 4B)和Bio-Rad Laboratories生產(chǎn)的Bio-gel A等。關(guān)于各種瓊脂糖凝膠的基本參數(shù)如附表所示。瓊脂糖凝膠在pH為4-9之間是穩(wěn)定的,它在室溫下很穩(wěn)定,穩(wěn)定性要超過一般的葡聚糖凝膠和聚丙烯酰胺凝膠。
瓊脂糖凝膠對(duì)樣品的吸附作用很小。另外瓊脂糖凝膠的機(jī)械強(qiáng)度和孔穴的穩(wěn)定性都很好,一般好于前兩種凝膠,在高鹽濃度下,柱床體積一般不會(huì)發(fā)生明顯變化,使用瓊脂糖凝膠時(shí)洗脫速度可以比較快。
瓊脂糖凝膠的排阻極限很大,分離范圍很廣,適合于分離大分子物質(zhì),但分辨率較低。瓊脂糖凝膠不耐高溫,使用溫度以0-30 ?C為宜。
Sepharose與2,3二溴丙醇反應(yīng),形成Sepharose CL型凝膠(CL-2B ? CL-4B),它們的分離特性基本沒有改變,但熱穩(wěn)定性和化學(xué)穩(wěn)定性都有所提高,可以在更廣泛的pH范圍內(nèi)應(yīng)用,穩(wěn)定工作的pH范圍為3-13。Sepharose CL型凝膠還特別適合于含有有機(jī)溶劑的分離。
4、聚丙烯酰胺和瓊脂糖交聯(lián)凝膠
這類凝膠是由交聯(lián)的聚丙烯酰胺和嵌入凝膠內(nèi)部的瓊脂糖組成。它們主要由LKB提供,商品名為Ultragel。這種凝膠由于含有聚丙烯酰胺,所以有較高分辨率;而它又含有瓊脂糖,這使得它又有較高的機(jī)械穩(wěn)定性,可以使用較高的洗脫速度。調(diào)整聚丙烯酰胺和瓊脂糖的濃度可以使Ultragel有不同的分離范圍,
5、多孔硅膠、多孔玻璃珠
多孔硅膠和多孔玻璃珠都屬于無(wú)機(jī)凝膠。顧名思義,它們就是將硅膠或玻璃制成具有一定直徑的網(wǎng)孔狀結(jié)構(gòu)的球形顆粒。
這類凝膠屬于硬質(zhì)無(wú)機(jī)凝膠,它們的最大的特點(diǎn)是機(jī)械強(qiáng)度很高、化學(xué)穩(wěn)定性好,使用方便而且壽命長(zhǎng),無(wú)機(jī)膠一般柱效較低,但用微粒的多孔硅膠制成的HPLC柱也可以有很高的柱效,可以達(dá)到4?104塔板 / 米。多孔玻璃珠易破碎,不能填裝緊密,所以柱效相對(duì)較低。
多孔硅膠和多孔玻璃珠的分離范圍都比較寬,多孔硅膠一般為102-5?106,多孔玻璃珠一般為3?103-9?106。它們的最大缺點(diǎn)是吸附效應(yīng)較強(qiáng)(尤其是多孔硅膠),可能會(huì)吸附比較多的蛋白,但可以通過表面處理和選擇洗脫液來降低吸附。另外它們也不能用于強(qiáng)堿性溶液,一般使用時(shí)pH應(yīng)小于8.5。
另外值得一提的是各類凝膠技術(shù)近年來發(fā)展得很快,目前已研制出很多性能優(yōu)越的新型凝膠。例如Pharmacia Biotech的Superdex和Superrose,Superdex的分辨率非常高,化學(xué)物理穩(wěn)定性也很好,可以用于FPLC、HPLC分析;而Superose的分離范圍很廣,分辨率較高,可以一次性的分離分子量差異較大的混合物。
同時(shí)它的機(jī)械穩(wěn)定性也很好。關(guān)于各種凝膠產(chǎn)品的詳細(xì)情況可以參閱本書附錄以及各個(gè)公司的產(chǎn)品目錄。
凝膠的選擇、處理和保存
1、凝膠的選擇
通過前面的介紹可以看到凝膠的種類、型號(hào)很多。不同類型的凝膠在性質(zhì)以及分離范圍上都有較大的差別,所以在進(jìn)行凝膠層析實(shí)驗(yàn)時(shí)要根據(jù)樣品的性質(zhì)以及分離的要求選擇合適的凝膠,這是影響凝膠層析效果好壞的一個(gè)關(guān)鍵因素。
一般來講,選擇凝膠首先要根據(jù)樣品的情況確定一個(gè)合適的分離范圍,根據(jù)分離范圍來選擇合適型號(hào)的凝膠。一般的凝膠層析實(shí)驗(yàn)可以分為兩類:分組分離(group separations)和分級(jí)分離(fractionations),分組分離是指將樣品混合物按分子量大小分成兩組,一組分子量較大,另一組分子量較小。
例如蛋白樣品的脫鹽或蛋白、核酸溶液去除小分子雜質(zhì)以及一些注射劑去除大分子熱源物質(zhì)等等。分級(jí)分離則是指將一組分子量比較接近的組分分開。在分組分離時(shí)要選擇能將大分子完全排阻而小分子完全滲透的凝膠,這樣分離效果好。一般常用排阻極限較小的凝膠類型。
分級(jí)分離時(shí)則要根據(jù)樣品組分的具體情況來選擇凝膠的類型,凝膠的分離范圍一方面應(yīng)包括所要的各個(gè)組分的分子量,另一方面要合適,不能過大。如果分離范圍選擇過小,則某些組分不能得到分離;如分離范圍選擇過大,則分辨率較低,分離效果也不好。
選擇凝膠另外一個(gè)方面就是凝膠顆粒的大小。顆粒小,分辨率高,但相對(duì)流速慢,實(shí)驗(yàn)時(shí)間長(zhǎng),有時(shí)會(huì)造成擴(kuò)散現(xiàn)象嚴(yán)重;顆粒大,流速快,分辨率較低但條件得當(dāng)也可以得到滿意的結(jié)果。
選擇時(shí)要依據(jù)分離的具體情況而定,例如樣品中各個(gè)組分差別較大,則可以選用大顆粒的凝膠,這樣可以很快的達(dá)到分離的目的;如果有個(gè)別組分差別較小,則要考慮使用小顆粒凝膠以提高分辨率。由于凝膠一般都比較穩(wěn)定,所以它在一般的實(shí)驗(yàn)條件下都可以正常的工作。
如果實(shí)驗(yàn)條件比較特殊,如在較強(qiáng)的酸堿中進(jìn)行或含有有機(jī)溶劑等等,則要仔細(xì)查看凝膠的工作參數(shù),選擇合適的類型的凝膠。
2、凝膠的處理
凝膠使用前要首先要進(jìn)行處理。選擇好凝膠的類型后,首先要根據(jù)選擇的層析柱估算出凝膠的用量。由于市售的葡聚糖凝膠和丙烯酰胺凝膠通常是無(wú)水的干膠,所以要計(jì)算干膠用量:干膠用量(g)=柱床體積(ml)/ 凝膠的床體積(ml / g)。 由于凝膠處理過程以及實(shí)驗(yàn)過程可能有一定損失,所以一般凝膠用量在計(jì)算的基礎(chǔ)上再增加10%-20%。
葡聚糖凝膠和丙烯酰胺凝膠干膠的處理首先是在水中膨化,不同類型的凝膠所需的膨化時(shí)間不同。一般吸水率較小的凝膠(即型號(hào)較小、排阻極限較小的凝膠)膨化時(shí)間較短,在20 ?C條件下需3-4小時(shí);但吸水率較大的凝膠(即型號(hào)較大、排阻極限較大的凝膠)膨化時(shí)間則較長(zhǎng),20 ?C條件下需十幾個(gè)到幾十個(gè)小時(shí),如Sephadex G-100以上的干膠膨化時(shí)間都要在72小時(shí)以上。
如果加熱煮沸,則膨化時(shí)間會(huì)大大縮短,一般在1-5小時(shí)即可完成,而且煮沸也可以去除凝膠顆粒中的氣泡。但應(yīng)注意盡量避免在酸或堿中加熱,以免凝膠被破壞。瓊脂糖凝膠和有些市售凝膠是水懸浮的狀態(tài),所以不需膨化處理。另外多孔玻璃珠和多孔硅膠也不需膨化處理。
膨化處理后,要對(duì)凝膠進(jìn)行純化和排除氣泡。純化可以反復(fù)漂洗,傾瀉去除表面的雜質(zhì)和不均一的細(xì)小凝膠顆粒。也可以一定的酸或堿浸泡一段時(shí)間,再用水洗至中性。排除凝膠中的氣泡是很重要的,否則會(huì)影響分離效果,可以通過抽氣或加熱煮沸的方法排除氣泡。
3、凝膠的保存
凝膠的保存一般是反復(fù)洗滌去除蛋白等雜質(zhì),然后加入適當(dāng)?shù)目咕鷦ǔ<尤?.02%的疊氮化鈉,4 ?C下保存。如果要較長(zhǎng)時(shí)間的保存,則要將凝膠洗滌后脫水、干燥,可以將凝膠過濾抽干后浸泡在50%的乙醇中脫水,抽干后再逐步提高乙醇濃度反復(fù)浸泡脫水,至95%乙醇脫水后將凝膠抽干。置于60 ?C烘箱中烘干,即可裝瓶保存。注意膨化的凝膠不能直接高溫烘干,否則可能會(huì)破壞凝膠的結(jié)構(gòu)。
凝膠層析的基本操作
凝膠層析的基本操作步驟與前面介紹的柱層析的操作過程基本相似,這里就不再重復(fù)了。下面主要介紹凝膠層析操作中應(yīng)注意的一些具體問題。
1、層析柱的選擇
層析柱大小主要是根據(jù)樣品量的多少以及對(duì)分辨率的要求來進(jìn)行選擇。一般來講,主要是層析柱的長(zhǎng)度對(duì)分辨率影響較大,長(zhǎng)的層析柱分辨率要比短的高;但層析柱長(zhǎng)度不能過長(zhǎng),否則會(huì)引起柱子不均一、流速過慢等實(shí)驗(yàn)上的一些困難。
一般柱長(zhǎng)度不超過100cm,為得到高分辨率,可以將柱子串聯(lián)使用。層析柱的直徑和長(zhǎng)度比一般在1:25-1:100之間。用于分組分離的凝膠柱,如脫鹽柱由于對(duì)分辨率要求較低,所以一般比較短。
2、凝膠柱的鑒定
凝膠柱的填裝情況將直接影響分離效果,關(guān)于填裝的方法前面已有介紹,這里主要介紹對(duì)填裝好的凝膠柱的鑒定。凝膠柱填裝后用肉眼觀察應(yīng)均勻、無(wú)紋路、無(wú)氣泡。另外通常可以采用一種有色的物質(zhì),如藍(lán)色葡聚糖-2000、血紅蛋白等上柱,觀察有色區(qū)帶在柱中的洗脫行為以檢測(cè)凝膠柱的均勻程度。
如果色帶狹窄、平整、均勻下降,則表明柱中的凝膠填裝情況較好,可以使用;如果色帶彌散、歪曲,則需重新裝柱。另外值得一提的是,有時(shí)為了防止新凝膠柱對(duì)樣品的吸附,可以用一些物質(zhì)預(yù)先過柱,以消除吸附。
3、洗脫液的選擇
由于凝膠層析的分離原理是分子篩作用,它不象其它層析分離方式主要依賴于溶劑強(qiáng)度和選擇性的改變來進(jìn)行分離,在凝膠層析中流動(dòng)相只是起運(yùn)載工具的作用,一般不依賴于流動(dòng)相性質(zhì)和組成的改變來提高分辨率,改變洗脫液的主要目的是為了消除組分與固定相的吸附等相互作用,所以和其它層析方法相比,凝膠層析洗脫液的選擇不那么嚴(yán)格。
由于凝膠層析的分離機(jī)理簡(jiǎn)單以及凝膠穩(wěn)定工作的pH范圍較廣,所以洗脫液的選擇主要取決于待分離樣品,一般來說只要能溶解被洗脫物質(zhì)并不使其變性的緩沖液都可以用于凝膠層析。為了防止凝膠可能有吸附作用,一般洗脫液都含有一定濃度的鹽。
4、加樣量
關(guān)于加樣前面已經(jīng)有所介紹,要盡量快速、均勻。另外加樣量對(duì)實(shí)驗(yàn)結(jié)果也可能造成較大的影響,加樣過多,會(huì)造成洗脫峰的重疊,影響分離效果;加樣過少,提純后各組分量少、濃度較低,實(shí)驗(yàn)效率低。
加樣量的多少要根據(jù)具體的實(shí)驗(yàn)要求而定:凝膠柱較大,當(dāng)然加樣量就可以較大;樣品中各組分分子量差異較大,加樣量也可以較大;一般分級(jí)分離時(shí)加樣體積約為凝膠柱床體積的1%-5%左右,而分組分離時(shí)加樣體積可以較大,一般約為凝膠柱床體積的10%-25%。
如果有條件可以首先以較小的加樣量先進(jìn)行一次分析,根據(jù)洗脫峰的情況來選擇合適的加樣量。設(shè)要分離的兩個(gè)組分的洗脫體積分別為Ve1和Ve2,那么加樣量不能超過(Ve1-Ve2)。
實(shí)際由于樣品擴(kuò)散,所以加樣量應(yīng)小于這個(gè)值。從洗脫峰上看,如果所要的各個(gè)組分的洗脫峰分得很開,為了提高效率,可以適當(dāng)增加加樣量;如果各個(gè)組分的洗脫峰只是剛好分開或沒有完全分開,則不能再加大加樣量,甚至要減小加樣量。另外加樣前要注意,樣品中的不溶物必須在上樣前去掉,以免污染凝膠柱。樣品的粘度不能過大,否則會(huì)影響分離效果。
5、洗脫速度
洗脫速度也會(huì)影響凝膠層析的分離效果,一般洗脫速度要恒定而且合適。保持洗脫速度恒定通常有兩種方法,一種是使用恒流泵,另一種是恒壓重力洗脫。洗脫速度取決于很多因素,包括柱長(zhǎng)、凝膠種類、顆粒大小等,一般來講,洗脫速度慢一些樣品可以與凝膠基質(zhì)充分平衡,分離效果好
。但洗脫速度過慢會(huì)造成樣品擴(kuò)散加劇、區(qū)帶變寬,反而會(huì)降低分辨率,而且實(shí)驗(yàn)時(shí)間會(huì)大大延長(zhǎng);所以實(shí)驗(yàn)中應(yīng)根據(jù)實(shí)際情況來選擇合適的洗脫速度,可以通過進(jìn)行預(yù)備實(shí)驗(yàn)來選擇洗脫速度。一般凝膠的流速是2-10 cm / hr,市售的凝膠一般會(huì)提供一個(gè)建議流速,可供參考。
總之,凝膠層析的各種條件,包括凝膠類型、層析柱大小、洗脫液、上樣量、洗脫速度等等,都要根據(jù)具體的實(shí)驗(yàn)要求來選擇。
例如樣品中各個(gè)組分差異較小,則實(shí)驗(yàn)要求凝膠層析要有較高的分辨率,提高分辨率的選擇應(yīng)主要包括:選擇包括各個(gè)待分離組分但分離范圍盡量小一些的凝膠,選擇顆粒小的凝膠,選擇分辨率高的凝膠類型,選擇較長(zhǎng)、直徑較大的層析柱、減少加樣量、降低洗脫速度等等。
但正如前面講過的,各種選擇都有一個(gè)限度的問題,超過這個(gè)限度可能會(huì)產(chǎn)生相反的效果。另外需要提的一點(diǎn)是,實(shí)驗(yàn)時(shí)應(yīng)盡可能的參考相關(guān)實(shí)驗(yàn)和文獻(xiàn)以及進(jìn)行預(yù)實(shí)驗(yàn),以選擇最合適的實(shí)驗(yàn)條件。
凝膠層析的應(yīng)用
前面介紹了凝膠層析的基本理論以及基本實(shí)驗(yàn)操作,下面簡(jiǎn)單介紹一下凝膠層析在生物學(xué)方面的應(yīng)用。
1、生物大分子的純化
凝膠層析是依據(jù)分子量的不同來進(jìn)行分離的,由于它的這一分離特性,以及它具有簡(jiǎn)單、方便、不改變樣品生物學(xué)活性等優(yōu)點(diǎn),使得凝膠層析成為分離純化生物大分子的一種重要手段,尤其是對(duì)于一些大小不同,但理化性質(zhì)相似的分子,用其它方法較難分開,而凝膠層析無(wú)疑是一種合適的方法。例如對(duì)于不同聚合程度的多聚體的分離等。
2、分子量測(cè)定
前面已經(jīng)介紹了,在一定的范圍內(nèi),各個(gè)組分的Kav以及Ve與其分子量的對(duì)數(shù)成線性關(guān)系。
Kav=-b lg MW+c
Ve=-b’ lg MW+c’
由此通過對(duì)已知分子量的標(biāo)準(zhǔn)物質(zhì)進(jìn)行洗脫,作出Ve或Kav對(duì)分子量對(duì)數(shù)的標(biāo)準(zhǔn)曲線,然后在相同的條件下測(cè)定未知物的Ve或Kav,通過標(biāo)準(zhǔn)曲線即可求出其分子量。凝膠層析測(cè)定分子量操作比較簡(jiǎn)單,所需樣品量也較少,是一種初步測(cè)定蛋白分子量的有效方法。
這種方法的缺點(diǎn)是測(cè)量結(jié)果的準(zhǔn)確性受很多因素影響。
由于這種方法假定標(biāo)準(zhǔn)物和樣品與凝膠都沒有吸附作用,所以如果標(biāo)準(zhǔn)物或樣品與凝膠有一定的吸附作用,那么測(cè)量的誤差就會(huì)比較大;上面公式成立的條件是蛋白基本是球形的,對(duì)于一些纖維蛋白等細(xì)長(zhǎng)的形狀的蛋白不成立,所以凝膠層析不能用于測(cè)定這類分子的分子量;
另外由于糖的水合作用較強(qiáng),所以用凝膠層析測(cè)定糖蛋白時(shí),測(cè)定的分子量偏大,而測(cè)定鐵蛋白時(shí)則發(fā)現(xiàn)測(cè)定值偏小;還要注意的是標(biāo)準(zhǔn)蛋白和所測(cè)定的蛋白都要在凝膠層析的線性范圍之內(nèi)。
3、脫鹽及去除小分子雜質(zhì)
利用凝膠層析進(jìn)行脫鹽及去除小分子雜質(zhì)是一種簡(jiǎn)便、有效、快速的方法,它比一般用透析的方法脫鹽要快得多,而且一般不會(huì)造成樣品較大的稀釋,生物分子不易變性。一般常用的是Sephadex G-25,另外還有Bio-Gel P-6 DG或Ultragel AcA 202等排阻極限較小的凝膠類型。目前已有多種脫鹽柱成品出售,使用方便,但價(jià)格較貴。
4、去熱源物質(zhì)
熱源物質(zhì)是指微生物產(chǎn)生的某些多糖蛋白復(fù)合物等使人體發(fā)熱的物質(zhì)。它們是一類分子量很大的物質(zhì),所以可以利用凝膠層析的排阻效應(yīng)將這些大分子熱源物質(zhì)與其它相對(duì)分子量較小的物質(zhì)分開。例如對(duì)于去除水、氨基酸、一些注射液中的熱源物質(zhì),凝膠層析是一種簡(jiǎn)單而有效的方法。
5、溶液的濃縮
利用凝膠顆粒的吸水性可以對(duì)大分子樣品溶液進(jìn)行濃縮。例如將干燥的Sephadex(粗顆粒)加入溶液中,Sephadex可以吸收大量的水,溶液中的小分子物質(zhì)也會(huì)滲透進(jìn)入凝膠孔穴內(nèi)部,而大分子物質(zhì)則被排阻在外。通過離心或過濾去除凝膠顆粒,即可得到濃縮的樣品溶液。這種濃縮方法基本不改變?nèi)芤旱碾x子強(qiáng)度和pH值
分子排阻層析主要是利用蛋白分子量的不同,在層析介質(zhì)中所受到的阻力不同,從而待分離的蛋白可以按照分量大小先后流出。分子排阻層析操作簡(jiǎn)單、所需實(shí)驗(yàn)條件溫和,不易改變待分離蛋白的生物活性,具有廣泛的應(yīng)用范圍。
北京天優(yōu)福康生物科技有限公司
官網(wǎng):http://www.jyzjsd.com/
服務(wù)熱線:400-860-6160
聯(lián)系電話/微信:13718308763
QQ:2136615612 3317607072
E-mail:Tianyoubzwz@163.com