原位聚合酶鏈式反應(in situ PCR)和原位反轉錄聚合酶鏈式反應(in situ RT-PCR)操作規程
(一)、儀器設備
英國 Thermo Hybaid 原位 PCR 儀。
(二)、操作流程
1 、原位 PCR 步驟
1 )預處理:
( 1 )切片常規脫蠟;
( 2 ) 0.2mol/L HCl 處理 10min ;
( 3 ) 5 μ g/ml 蛋白酶 K 消化組織 37 ℃ 10min ;
( 4 ) Nase 消化組織 37 ℃ 30min ;
( 5 )梯度酒精脫水,室溫干燥。
2 )原位擴增:
( 1 )切片滴加特異性序列引物 30 μ LPCR 擴增反應液,覆蓋硅化蓋玻片,石蠟油封邊;
( 2 ) PCR 熱循環: 94 ℃, 1min ; 55 ℃, 1min ; 72 ℃, 1.5min ,共 25 ~ 30 個循環, 72 ℃延伸 10min ;
( 3 )氯仿洗去蓋玻片, 4 %多聚甲醛后固定 10min ,梯度酒精脫水,干燥。
3) 原位雜交:
( 1 )加地高辛標記探針的雜交液, 98 ℃變性 10min , -20 ℃退火 5min , 42 ℃雜交過夜。
( 2 )雜交后用 2×SSC 洗滌 10min , 3 次, 1×SSC 洗滌 10min , 3 次;
( 3 )緩沖液洗滌 10min , 3 次;
( 4 )加堿性磷酸酶標記的羊抗地高辛抗體復合物, 37 ℃, 2h ;
( 5 )緩沖液洗滌 5min , 3 次;
( 6 ) NBT 、 BCIP 暗處顯色,鏡下控制,終止顯色。
( 7 )常規脫水:透明、封固。
2 、原位 RT-PCR 步驟
1 )預處理:
( 1 )蛋白酶 K(0.3mg/mL) 54 ℃消化 20min ,蒸餾水洗;
( 2 ) 95 ℃加熱 3min ,滅活殘存的蛋白酶。
2 )原位擴增:
( 1 )在有 RNA 酶抑制劑存在的條件下,用隨機六聚物進行逆轉錄反應;
( 2 )用熱啟動法進行 PCR 擴增。標本加熱至 75 ℃時加上反應液,覆以蓋玻片,四周用指甲油密封。然后將溫度升至 95 ℃, 2min 。再將熱循環儀設定為 95 ℃, 45s , 55 ℃, 1min 和 75 ℃, 45s ,共 26 次循環;
( 3 )擴增結束后,在 80 ℃烤 15min ~ 30min 。
3 )原位雜交:
( 1 )雜交前標本 95 ℃加熱 3min ;
( 2 )加上雜交液,濕盒內 50 ℃過夜; 雜交液組成: 25 %硫酸葡聚糖, 2×SSC , 50 %甲酰胺, 0.33mg/ml 變性的鮭魚精子 DNA , 每 0 . 5mL 雜交液內含生物素標記探針 1ng 。
( 3 )擴增的β - 肌動蛋白和 IL-6 用 DAKO 檢測試劑盒 K600( 鏈霉卵白素,生物素標記的堿性磷酸酶和硝基四氮唑藍 ) 檢測。陽性反應呈紫色。
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