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中國微生物菌種

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系統(tǒng)發(fā)現(xiàn)細(xì)菌毒素的抗細(xì)菌和抗真菌活性
發(fā)布日期:2024-11-29 09:08:27


系統(tǒng)發(fā)現(xiàn)細(xì)菌毒素的抗細(xì)菌和抗真菌活性


微生物毒素是細(xì)菌在競(jìng)爭(zhēng)中進(jìn)化出的重要工具,通過作用于DNA、細(xì)胞膜等關(guān)鍵成分殺死或抑制其他微生物,從而改變微生物群落的組成。多態(tài)性毒素因其模塊化結(jié)構(gòu)和多樣化作用機(jī)制而備受關(guān)注,具有通過多種分泌系統(tǒng)傳遞毒性并對(duì)不同目標(biāo)產(chǎn)生影響的能力。然而,目前對(duì)多態(tài)性毒素的研究仍存在顯著不足,尤其是在系統(tǒng)發(fā)現(xiàn)新型毒素及其免疫機(jī)制方面。


本研究旨在通過開發(fā)計(jì)算方法系統(tǒng)篩選微生物基因組中的新型多態(tài)性毒素及其伴隨的免疫基因,解析其在細(xì)菌間競(jìng)爭(zhēng)和生態(tài)系統(tǒng)中的作用機(jī)制。這不僅有助于深入了解微生物生態(tài)學(xué),還為抗菌和抗真菌藥物開發(fā)提供了重要的理論基礎(chǔ),特別是在抗生素耐藥性日益普遍的背景下。


1. 新型多態(tài)性毒素的發(fā)現(xiàn):開發(fā)了一種計(jì)算框架,系統(tǒng)篩選了來自105,438個(gè)微生物基因組的多態(tài)性毒素候選基因,識(shí)別出217個(gè)潛在毒素結(jié)構(gòu)域。從中篩選并驗(yàn)證了9種新型毒素C端結(jié)構(gòu)域,這些毒素對(duì)細(xì)菌(如大腸桿菌)和真菌(如釀酒酵母)表現(xiàn)出強(qiáng)毒性。這些毒素存在于多種微生物門類中,包括許多病原菌(如銅綠假單胞菌、沙門氏菌和肺炎克雷伯菌)。

2. 毒素的功能與作用機(jī)制

  • 毒素的殺傷機(jī)制:部分毒素(如PT1和PT7)具有DNA內(nèi)切酶活性,通過降解宿主DNA實(shí)現(xiàn)毒性作用。某些毒素(如PT4和PT9)通過攻擊細(xì)胞膜導(dǎo)致目標(biāo)細(xì)胞膜完整性喪失。毒素(如PT2和PT6)通過抑制細(xì)胞分裂或破壞細(xì)胞壁導(dǎo)致細(xì)胞形態(tài)異常。
  • 毒素的靶向特異性:毒素表現(xiàn)出針對(duì)不同目標(biāo)(細(xì)菌或真菌)的選擇性,并顯示出對(duì)特定病原體的高效殺傷力。

3. 免疫基因的發(fā)現(xiàn)與功能:發(fā)現(xiàn)了5種新型伴隨免疫基因,這些基因能保護(hù)毒素產(chǎn)生的宿主細(xì)胞免受自我毒害。實(shí)驗(yàn)表明免疫蛋白與毒素形成復(fù)合物,通過遮蓋毒素的催化位點(diǎn)阻止其毒性作用。

4. 抗菌和抗真菌活性:毒素對(duì)革蘭氏陽性細(xì)菌和多種致病真菌表現(xiàn)出強(qiáng)效殺傷作用。某些毒素(如PT4和PT9)顯示出對(duì)人類病原真菌的高效殺傷能力,但對(duì)無脊椎動(dòng)物和哺乳動(dòng)物細(xì)胞無毒性。毒素在細(xì)菌-真菌競(jìng)爭(zhēng)中發(fā)揮重要生態(tài)作用。例如,一些毒素能夠顯著抑制植物病原真菌(如尖孢鐮刀菌)的菌絲生長(zhǎng)和孢子萌發(fā)。

5. 毒素的三維結(jié)構(gòu)解析:通過三維結(jié)構(gòu)解析(包括晶體結(jié)構(gòu)和AlphaFold預(yù)測(cè)),揭示了毒素的獨(dú)特蛋白折疊和催化位點(diǎn)。解析了PT1和PT7的催化活性位點(diǎn),并證明這些毒素是通過與金屬離子(如Mg2?)結(jié)合實(shí)現(xiàn)核酸酶活性的。

6. 生態(tài)學(xué)和進(jìn)化意義:毒素在各種生態(tài)系統(tǒng)(如水生環(huán)境、植物相關(guān)生態(tài)系統(tǒng)和宿主相關(guān)環(huán)境)中廣泛存在,并對(duì)微生物群落的動(dòng)態(tài)平衡產(chǎn)生深遠(yuǎn)影響。毒素通常通過III型、V型或VI型分泌系統(tǒng)傳遞,其靶向多樣性可能由分泌系統(tǒng)的適應(yīng)性調(diào)控。

7. 潛在應(yīng)用:毒素的選擇性和高效殺傷作用為開發(fā)新型抗生素提供了可能,特別是在抗生素耐藥性問題日益嚴(yán)重的背景下。毒素的核酸酶活性為基因編輯技術(shù)和其他生物技術(shù)應(yīng)用提供了新的工具。

主要結(jié)論

本研究顯著擴(kuò)展了對(duì)多態(tài)性毒素的認(rèn)知,揭示了其多樣化的功能機(jī)制及其在微生物生態(tài)系統(tǒng)中的重要作用。毒素不僅在細(xì)菌間競(jìng)爭(zhēng)中具有關(guān)鍵性,還在抗真菌和抗菌領(lǐng)域展示了應(yīng)用潛力。研究表明,這些毒素是高度特化的分子工具,其在微生物生態(tài)和生物技術(shù)應(yīng)用中的價(jià)值有待進(jìn)一步探索。