葡聚糖凝膠過濾法測(cè)定蛋白質(zhì)分子量方法
實(shí)驗(yàn)原理
葡聚糖凝膠(Sephadex)過濾法測(cè)定蛋白質(zhì)分子 量的原理,主要是依據(jù)這種凝膠具有分子篩作用,一定型號(hào)的凝膠具有大體上一定大小的孔徑。在一定的凝膠柱內(nèi),凝膠孔隙所占的體積稱為內(nèi)水容積Vi,凝膠顆粒間的自由空間所占的體積稱為外水容積V0。當(dāng)樣品流經(jīng)凝膠柱時(shí),大于孔隙的大分子完全不滲入到凝膠內(nèi)部,只需V0體積的洗脫液便可將其由一端洗脫到另一端;相反,如果樣品體積小于孔隙,則需要V0+Vi體積的洗脫液,才能將它們由一端洗脫到另一端。中等分子(分子大小在上述兩種極限之間)所需洗脫液體積介于兩者之間,Ve=V0+KdVi(0<1),如圖4.1所示。< p=""> <1),如圖4.1所示。<>
Kd為分配系數(shù),它表示一種物質(zhì)在孔隙內(nèi)的滲透程度,相當(dāng)于這種物質(zhì)在孔隙內(nèi)所占體積和孔隙總體積的比值。

如果假定蛋白質(zhì)分子近于球形,同時(shí)沒有顯著的水合作用,則不同大小分子 量的蛋白質(zhì),進(jìn)入凝膠篩孔的程度不同,其洗脫體積決定于分子大小。當(dāng)?shù)鞍踪|(zhì)分子量在10000~15000時(shí),蛋白質(zhì)在葡聚糖凝膠柱上層析的洗脫體積和分子量的對(duì)數(shù)呈直線關(guān)系。若用已知分子量的標(biāo)準(zhǔn)蛋白質(zhì)在一定型號(hào)葡聚糖凝膠柱上層析,精確測(cè)其洗脫體積,并以洗脫體積Ve對(duì)分子量的對(duì)數(shù)logMW作圖,可獲得一條標(biāo)準(zhǔn)曲線(見圖4.2)。未知分子量的蛋白質(zhì)在相同條件下層析,根據(jù)其洗脫體積即可在標(biāo)準(zhǔn)曲線上求得分子量。

圖 4.2三個(gè)不同大小分子 組份上柱洗脫曲線示意圖
本方法測(cè)分子 量設(shè)備簡(jiǎn)單,結(jié)果處理方便,因此應(yīng)用較廣泛。但本方法僅適用于軸比相近似為球狀蛋白,對(duì)軸比大的纖維蛋白不適用;對(duì)含量大于5%的糖蛋白因有較大水合作用,測(cè)得分子量偏高;對(duì)含鐵蛋白測(cè)定數(shù)據(jù)偏低。

圖4.3Ve 對(duì)log MW作圖
由于Ve與柱的大小有關(guān),如果用Ve/V0對(duì)logMW作圖,同樣可得一線性關(guān)系的標(biāo)準(zhǔn)曲線,且可消除柱的大小和吸附效應(yīng)的誤差(見圖4.3)。
1. 細(xì)胞色素c 2. 核糖核酸酶 3. 肌紅蛋白 4. α-胰凝乳蛋白酶 5. 胰蛋白酶 6. 胃蛋白酶 7. 過氧化物酶 8. 卵清蛋白 9. 血清白蛋白 10. 鐵蛋白

圖4.4 Ve / V0對(duì)log MW作圖
試劑和器材
一、試劑洗脫液:0.05M Tris-HCl緩沖液(pH7.5),0.1M KCl溶液:稱取12.12g Tris,15g KCl,先用少量去離子水溶解,再加入6.67mL濃HCl,用去離子水定容至2L。
藍(lán)色葡聚糖2000;Sephsdex G-100;N-乙酰酪氨酸乙酯飽和溶液(以洗脫液飽和)。
二、材料
牛血清白蛋白(Mr 67 000);卵清蛋白(Mr 43 000);胰凝乳蛋白酶原(Mr 25 000);細(xì)胞色素c(Mr 12 800)。
三、儀器層析柱;恒壓洗脫瓶; 紫外檢測(cè)儀或紫外分光光度計(jì);自動(dòng)分部收集器。
操作方法
一、溶脹凝膠
取Sephadex G-100 15g,加200mL蒸餾水,沸水浴中溶脹5小時(shí)。待溶脹平衡后,傾去上層清液,包括細(xì)顆粒,然后再放些蒸餾水?dāng)噥y,靜置使凝膠下沉,再傾去上層清液,至無細(xì)顆粒為止。溶脹平衡和漂洗凈的凝膠經(jīng)減壓抽氣除去氣泡,即可準(zhǔn)備裝柱。
二、裝柱
層析柱必須粗細(xì)均勻,柱管大小可根據(jù)試劑需要選擇。一般柱直徑(內(nèi)徑)為1cm, 如果樣品量比較多,最好用直徑2 ~ 3cm的柱。通常柱愈長(zhǎng),分離效果愈好,但柱過長(zhǎng),實(shí)驗(yàn)時(shí)間長(zhǎng)而且樣品稀釋度大,易擴(kuò)散,反而分離效果不好。當(dāng)用作脫鹽時(shí),柱高度為50cm比較合適;在進(jìn)行分級(jí)分離時(shí),100cm高度就夠了。
裝柱時(shí),將柱垂直至于鐵架上。在柱中加約1/3柱容積的洗脫液,并趕凈濾板下方氣泡,使支持濾板底部完全充滿液體,然后將柱的出口關(guān)閉。把已經(jīng)溶脹好的凝膠調(diào)成薄漿,傾入柱內(nèi),膠粒逐漸擴(kuò)散下沉。當(dāng)沉積的膠床至2~3cm高時(shí),打開柱的出口,并注意控制操作壓以均勻不變的流速直到膠裝完為止。柱裝好后,在床的上面蓋上一張大小略小與柱內(nèi)徑的濾紙片,以防止樣品中一些不溶物質(zhì)混入床中和加樣時(shí)凝膠被沖起。再以洗脫液平衡柱層,直至層析的膠床高不變?yōu)橹?。柱裝得是否均勻,可用藍(lán)色葡聚糖上柱檢驗(yàn);如果色帶均勻下移,說明柱子已裝好,可以使用。
三、上樣
稱取0.5mg藍(lán)色葡聚糖2000(分子量200萬以上)四份,分別放在稱量瓶中,再稱取標(biāo)準(zhǔn)蛋白牛血清白蛋白(Mr 67 000);卵清蛋白(Mr 43 000);胰凝乳蛋白酶原(Mr 25 000);細(xì)胞色素c(Mr 12 800)各10mg,分別放在各稱量瓶中;各瓶加入N-乙酰酪氨酸乙酯飽和溶液0.5mL,使混合物溶解后分別上柱。
樣品上柱是實(shí)驗(yàn)成敗的關(guān)鍵之一,若樣品稀釋或上柱不均,會(huì)使區(qū)帶擴(kuò)散,影響層析效果。上樣時(shí)應(yīng)盡量保持床面的穩(wěn)定。先打開柱的出口,待柱中洗脫液流至距床表面1~2mm時(shí),關(guān)閉出口,用滴管將樣品慢慢地加至柱床表面,打開出口并開始計(jì)算流出體積,當(dāng)樣品滲入床中接近床表面1mm時(shí)關(guān)閉出口,同加樣品時(shí)一樣小心地加入少量洗脫液,再打開柱的出口,使床表面的樣品也全部滲入柱內(nèi)。這時(shí)樣品已加好,在床的表面再小心地加洗脫液,使高出床表面3~5cm。
四、收集和鑒定
層析開始,在柱的出口處以試管分管收集流出液,流速為0.4mL/min, 4mL/管,收集液在280nm處測(cè)OD值。最高的一個(gè)OD值時(shí)的體積即為吸收峰的洗脫體積Ve。當(dāng)N-乙酰酪氨酸乙酯洗脫峰出現(xiàn)后(此峰洗脫體積不必記錄);按同樣的方法進(jìn)行第二個(gè)標(biāo)準(zhǔn)蛋白質(zhì)樣品的上柱,操作方法和步驟同前。
將各標(biāo)準(zhǔn)蛋白質(zhì)測(cè)得的洗脫體積Ve對(duì)它們的分子量對(duì)數(shù)作圖,則應(yīng)獲得一線性的標(biāo)準(zhǔn)曲線。
注意事項(xiàng)
(1)根據(jù)層析柱的容積和所選用的凝膠溶脹后住床容積,計(jì)算所需凝膠干粉的重量,以將用作洗脫劑的溶液使其充分溶脹。
(2)層析柱粗細(xì)必須均勻,柱管大小可根據(jù)試劑需要選擇。一般來說,細(xì)長(zhǎng)的柱分離效果較好。若樣品量多,最好選用內(nèi)徑較粗的柱,但此時(shí)分離效果稍差。柱管內(nèi)徑太小時(shí),會(huì)發(fā)生“管壁效應(yīng)”,即柱管中心部分的組份移動(dòng)慢,而管壁周圍的移動(dòng)快。柱越長(zhǎng),分離效果越好,但柱過長(zhǎng),實(shí)驗(yàn)時(shí)間長(zhǎng),樣品稀釋度大,分離效果反而不好。
對(duì)于脫鹽的柱一般都是短而粗,柱長(zhǎng)(L)/直徑(D)<10;對(duì)分級(jí)分離用的柱,L/D值可以比較大,對(duì)很難分離的組份可以達(dá)到L/D=100,一般選用內(nèi)徑為1cm,柱長(zhǎng)100cm就夠了。
(3)裝柱要均勻,不要過松也不要過緊,最好也在要求的操作壓下裝柱,流速不宜過快,避免因此而壓緊凝膠。但也不要過慢,使柱裝得太松,導(dǎo)致層析過程中,凝膠床高度下降。
(4)始終保持柱內(nèi)液面高于凝膠表面,否則水分揮發(fā),凝膠變干。
(5)用此方法測(cè)蛋白質(zhì)的相對(duì)分子量,受蛋白質(zhì)形狀的影響,并且測(cè)得的結(jié)果可能是聚合體的相對(duì)分子量,因而還需用電泳等方法進(jìn)一步驗(yàn)證相對(duì)分子量測(cè)定結(jié)果。
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