蛋白酶切的基礎問題
問:我在蛋白方面比較菜,我有個蛋白需要做酶切,蛋白表達主要是以包涵體為主,溶解在8mol/l 尿素,或者1%SDS中,蛋白已經變性了,請問蛋白酶切是否能在變性的條件下酶切,還是一定要等到蛋白復性以后才能酶切? 還請指點一二。能否這樣做,就是把變性的蛋白通過透析成酶切的緩沖液體系,然后再酶切,這樣那些變性的尿素和SDS都去除,不知道這樣操作符不符合理論?
答:既然你的蛋白是包涵體,為什么不直接連接到pet21或者pet24中,這樣蛋白表達出來之后就是沒有tag,就少了酶切這一步了,不是嗎?
問:是這樣,我的課題是接著我上屆的師兄做的,有個3C蛋白酶切位點,表達的是膜蛋白,純化后需要酶切下來才行,但是我一直都沒有搞清一個概念,尿素等溶解蛋白是是變性劑,比如TRITON0100那些非離子去污劑溶解蛋白是非變性條件,兩者對蛋白來說有什么區別和不同呢,好象膜蛋白一般都是用TRITON-100來溶的,我表達餓這個膜蛋白不溶于TRIOTON ,而容于SDS或者尿素,我純化后該如何處理才能酶切呢?還請賜教。
答:是這樣,尿素和鹽酸胍是讓蛋白變性的,如果復性要去掉他們。triton x100或者sds之類的去垢劑是為了不溶于水的蛋白,例如你的膜蛋白,溶于水中的。
你可以查找一些關于膜蛋白復性的文章看看。
去垢劑,如果很強也可以讓蛋白變性,只是和尿素不是一樣的機理。
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