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如何提取總蛋白?
發布日期:2023-04-11 17:31:35


如何提取總蛋白?


大家目前最常用的方法是利用溶液法進行蛋白提取(如 RIPA 裂解液),但是往往會在蛋白質提取中產生兩個不同的組分,即 RIPA 可溶性和 RIPA 不可溶性組分。

通常 RIPA 不可溶性組分被我們直接丟棄忽略。但是已經有文章證實許多蛋白質存在于被丟棄的 RIPA 不可溶性組分中。

也就是說利用溶液法提取的并非是完整的總蛋白,而僅僅是一些可溶性蛋白。

溶液法進行提取蛋白時會人工激活 caspase-3 和 caspase-7;還會人工激活某些激酶活性;影響磷酸化研究;影響細胞外基質;影響定量,定性蛋白研究。

目前利用離心管柱式法進行蛋白提取,即可解決以上這些問題,只需加入裂解液,過柱離心,不產生不可溶組份,即可提取到完整的總蛋白!

動物組織總蛋白提取

變性總蛋白提取(SD-001)

以下步驟是從 15-20 mg 組織中提取,對于昆蟲組織,例如果蠅,使用 15-20 個幼蟲,蛹或成蟲樣本。如果起始量較大或者較小,需調整相應裂解液的用量比例。

1. 將離心管柱及接收管套管放在冰上預冷

2. 將 15-20 mg 組織放置于離心管柱上,用塑料棍扭轉研磨 50-60 次,加入 200ul 細胞裂解液,繼續研磨 30-60 次。(組織用量不要過量,無需過度研磨,裂解液可分兩次加入以得到最佳效果)注意:塑料研磨棒可以重復使用,用蒸餾水徹底沖洗干凈,用紙巾擦干。
3. 蓋上蓋子室溫孵育 1-2 分鐘,14000-16000rpm 離心 1-2 分鐘取出。

4. 立刻將收集管放置于冰上,棄去離心管柱,蛋白提取完成可應用于下游實驗。

請注意:部分未完全裂解的組織不會影響樣品質量。

天然總蛋白提取(SN-002)

1. 將天然細胞裂解液(SN-002),離心管柱及接收管套管放在冰上預冷。

2. 將 15-20 mg 組織放置于離心管柱上,用塑料棍扭轉研磨 50-60 次,加入 200ul 天然細胞裂解液(SN-002),繼續研磨 30-60 次。(組織用量不要過量,無需過度研磨,裂解液可分兩次加入以得到最佳效果)。注意:塑料研磨棒可以重復使用,用蒸餾水徹底沖洗干凈,用紙巾擦干。

3. 開蓋冰上孵育 5 分鐘,蓋上蓋子,4℃,14000-16000rpm 離心 1-2 分鐘取出。

4. 立刻將收集管放置于冰上,棄去離心管柱,蛋白提取完成可應用于下游實驗。

細胞樣品總蛋白提取

變性總蛋白提取(SD-001)

A.非貼壁細胞

1. 將離心管柱及接收管套管放在冰上預冷。
2. 低速離心收集細胞,在 1.5 ml 離心管中加入預冷的 PBS,旋窩震蕩,3000rpm 離心 2-3 分鐘清洗細胞。吸去上清,剩余與細胞體積相同體積的 PBS。渦旋震蕩重懸細胞。

3. 加入表格 1 中相應體積的細胞裂解液,渦旋震蕩裂解細胞。(細胞數量和裂解液須保證對應關系,以達到最佳提取效率)請注意:部分未完全裂解的細胞不會影響樣品質量。
4. 將裂解的細胞轉移到預冷的離心管柱套管中,14000-16000rpm 離心 30 秒取出

5. 立刻將收集管放置于冰上,棄去離心管柱,蛋白提取完成可應用于下游實驗。

表格 1,不同細胞體積應加入相應體積裂解液

細胞體積(ul)

裂解液(ul)

相當細胞量# X 106

3

20

0.3

5

50

0.5

10

100

1

20

200

2

40

500

3

﹡ NIH3T3 和 293T 細胞 10ul 體積相當于 1X106 個細胞

B. 貼壁細胞

1. 將離心管柱及接收管套管放在冰上預冷
2. 將預冷的 PBS 直接加入培養板,培養皿或培養瓶中清洗貼壁細胞,吸去上清。

3. 按照表 2 中將相應體積的細胞裂解液均勻的加入整個器皿表面,用移液器吹打幾次,將裂解的細胞轉移到預冷的離心管柱套管中,14000-16000rpm 離心 30 秒取出。(如提取濃度不佳,可減少裂解液使用量)
4. 立刻將收集管放置于冰上,棄去離心管柱,蛋白提取完成可應用于下游實驗。

表格 2,不同貼壁細胞量應加入相應體積裂解液

器皿

細胞數量

裂解液(ul)

24孔板

0.1-0.2 Million

50

6孔板

0.6-0.8 Million

200

25 cm2培養瓶

1.5-2 Million

500


天然總蛋白提取(SN-002)

A.非貼壁細胞
1. 將天然細胞裂解液(SN-002),離心管柱及接收管套管放在冰上預冷。

2. 低速離心收集細胞,在 1.5 ml 離心管中加入預冷的 PBS, 旋窩震蕩,3000rpm 離心 2-3 分鐘清洗細胞。吸去上清,剩余與細胞體積相同體積的 PBS。旋窩震蕩重懸細胞。
3. 加入表格 3 中相應體積的細胞裂解液,渦旋震蕩裂解細胞 15 秒。將離心管放置于冰上 3-5 分鐘然后渦旋震蕩 10 秒。(細胞數量和裂解液須保證對應關系,以達到最佳提取效率)

4. 將裂解的細胞轉移到預冷的離心管柱套管中,14000-16000rpm 離心 30 秒取出
5. 立刻將收集管放置于冰上,棄去離心管柱,蛋白提取完成可應用于下游實驗。

表格 3,不同細胞體積應加入相應體積裂解液

細胞體積(ul)

裂解液(ul)

相當細胞量# X 106

3

20

0.3

5

50

0.5

10

100

1

20

200

2

40

500

3

﹡ NIH3T3 和 293T 細胞 10ul 體積相當于 1X106 個細胞

B 貼壁細胞

1. 將天然細胞裂解液(SN-002),離心管柱及接收管套管放在冰上預冷。

2. 將預冷的 PBS 直接加入培養板,培養皿或培養瓶中清洗貼壁細胞兩次,吸去上清。

3. 按照表 4 中將相應體積的細胞裂解液均勻的加入整個器皿表面,放置于冰上孵育 5 分鐘,用移液器吹打幾次,將裂解的細胞轉移到預冷的離心管柱套管中,14000-16000rpm 離心 30 秒取出。(如提取濃度不佳,可減少裂解液使用量)
4. 立刻將收集管放置于冰上,棄去離心管柱,蛋白提取完成可應用于下游實驗。

表格 4,不同貼壁細胞量應加入相應體積裂解液

器皿

細胞數量

裂解液(ul)

24孔板

0.1-0.2 Million

50

6孔板

0.6-0.8 Million

250

25 cm2培養瓶

1.5-2 Million

500



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