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生物化學名詞解釋匯總
發布日期:2022-06-15 08:39:07


生物化學名詞解釋匯總


第一章 氨基酸


1,氨基酸(amino acid):是含有一個堿性氨基和一個酸性羧基的有機化合物,氨基一般連在α-碳上。


2,必需氨基酸(essential amino acid):指人(或其它脊椎動物)(賴氨酸,蘇氨酸等)自己不能合成,需要從食物中獲得的氨基酸。


3,非必需氨基酸(nonessential amino acid):指人(或其它脊椎動物)自己能由簡單的前體合成不需要從食物中獲得的氨基酸。


4,等電點(pI,isoelectric point):使分子處于兼性分子狀態,在電場中不遷移(分子的靜電荷為零)的pH值。


5,茚三酮反應(ninhydrin reaction):在加熱條件下,氨基酸或肽與茚三酮反應生成紫色(與脯氨酸反應生成黃色)化合物的反應。


6,肽鍵(peptide bond):一個氨基酸的羧基與另一個的氨基的氨基縮合,除去一分子水形成的酰氨鍵。


7,肽(peptide):兩個或兩個以上氨基通過肽鍵共價連接形成的聚合物。


8,蛋白質一級結構(primary structure):指蛋白質中共價連接的氨基酸殘基的排列順序。


9,層析(chromatography):按照在移動相和固定相 (可以是氣體或液體)之間的分配比例將混合成分分開的技術。


10,離子交換層析(ion-exchange column)使用帶有固定的帶電基團的聚合樹脂或凝膠層析柱


11,透析(dialysis):通過小分子經過半透膜擴散到水(或緩沖液)的原理,將小分子與生物大分子分開的一種分離純化技術。


12,凝膠過濾層析(gel filtration chromatography):也叫做分子排阻層析。

一種利用帶孔凝膠珠作基質,按照分子大小分離蛋白質或其它分子混合物的層析技術。


13,親合層析(affinity chromatograph):利用共價連接有特異配體的層析介質,分離蛋白質混合物中能特異結合配體的目的蛋白質或其它分子的層析技術。


14,高壓液相層析(HPLC):使用顆粒極細的介質,在高壓下分離蛋白質或其他分子混合物的層析技術。


15,凝膠電泳(gel electrophoresis):以凝膠為介質,在電場作用下分離蛋白質或核酸的分離純化技術。


16,SDS-聚丙烯酰氨凝膠電泳(SDS-PAGE):在去污劑十二烷基硫酸鈉存在下的聚丙烯酰氨凝膠電泳。

SDS-PAGE只是按照分子的大小,而不是根據分子所帶的電荷大小分離的。


17,等電聚膠電泳(IFE):利用一種特殊的緩沖液(兩性電解質)在聚丙烯酰氨凝膠制造一個pH梯度,電泳時,每種蛋白質遷移到它的等電點(pI)處,即梯度足的某一pH時,就不再帶有凈的正或負電荷了。


18,雙向電泳(two-dimensional electrophorese):等電聚膠電泳和SDS-PAGE的組合,即先進行等電聚膠電泳(按照pI)分離,然后再進行SDS-PAGE(按照分子大小分離)。經染色得到的電泳圖是二維分布的蛋白質圖。


19,Edman降解(Edman degradation):從多肽鏈游離的N末端測定氨基酸殘基的序列的過程。

N末端氨基酸殘基被苯異硫氰酸酯修飾,然后從多肽鏈上切下修飾的殘基,再經層析鑒定,余下的多肽鏈(少了一個殘基)被回收再進行下一輪降解循環。


20,同源蛋白質(homologous protein):來自不同種類生物的序列和功能類似的蛋白質,例如血紅蛋白。


第二章 蛋白質


1,構形(configuration):有機分子中各個原子特有的固定的空間排列。

這種排列不經過共價鍵的斷裂和重新形成是不會改變的。

構形的改變往往使分子的光學活性發生變化。


2,構象(conformation):指一個分子中,不改變共價鍵結構,僅單鍵周圍的原子放置所產生的空間排布。

一種構象改變為另一種構象時,不要求共價鍵的斷裂和重新形成。構象改變不會改變分子的光學活性。


3,肽單位(peptide unit):又稱為肽基(peptide group),是肽鍵主鏈上的重復結構。

是由參于肽鏈形成的氮原子,碳原子和它們的4個取代成分:羰基氧原子,酰氨氫原子和兩個相鄰α-碳原子組成的一個平面單位。


4,蛋白質二級結構(protein在蛋白質分子中的局布區域內氨基酸殘基的有規則的排列。

常見的有二級結構有α-螺旋和β-折疊。二級結構是通過骨架上的羰基和酰胺基團之間形成的氫鍵維持的。


5,蛋白質三級結構(protein tertiary structure):蛋白質分子處于它的天然折疊狀態的三維構象。

三級結構是在二級結構的基礎上進一步盤繞,折疊形成的。

三級結構主要是靠氨基酸側鏈之間的疏水相互作用,氫鍵,范德華力和鹽鍵維持的。


6,蛋白質四級結構(protein quaternary structure):多亞基蛋白質的三維結構。

實際上是具有三級結構多肽(亞基)以適當方式聚合所呈現的三維結構。


7,α-螺旋(α-heliv):蛋白質中常見的二級結構,肽鏈主鏈繞假想的中心軸盤繞成螺旋狀,一般都是右手螺旋結構,螺旋是靠鏈內氫鍵維持的。每個氨基酸殘基(第n個)的羰基與多肽鏈C端方向的第4個殘基(第4+n個)的酰胺氮形成氫鍵。

在古典的右手α-螺旋結構中,螺距為0.54 nm,每一圈含有3.6個氨基酸殘基,每個殘基沿著螺旋的長軸上升0.15 nm。


8, β-折疊(β-sheet): 蛋白質中常見的二級結構,是由伸展的多肽鏈組成的。

折疊片的構象是通過一個肽鍵的羰基氧和位于同一個肽鏈的另一個酰氨氫之間形成的氫鍵維持的。

氫鍵幾乎都垂直伸展的肽鏈,這些肽鏈可以是平行排列(由N到C方向)或者是反平行排列(肽鏈反向排列)。


9,β-轉角(β-turn):也是多肽鏈中常見的二級結構,是連接蛋白質分子中的二級結構(α-螺旋和β-折疊),使肽鏈走向改變的一種非重復多肽區,一般含有2~16個氨基酸殘基。含有5個以上的氨基酸殘基的轉角又常稱為環(loop)。

常見的轉角含有4個氨基酸殘基有兩種類型:轉角I的特點是:第一個氨基酸殘基羰基氧與第四個殘基的酰氨氮之間形成氫鍵;轉角Ⅱ的第三個殘基往往是甘氨酸。

這兩種轉角中的第二個殘侉大都是脯氨酸。


10,超二級結構(super-secondary structure):也稱為基元(motif).
。在蛋白質中,特別是球蛋白中,經常可以看到由若干相鄰的二級結構單元組合在一起,彼此相互作用,形成有規則的,在空間上能辨認的二級結構組合體。


11,結構域(domain):在蛋白質的三級結構內的獨立折疊單元。

結構域通常都是幾個超二級結構單元的組合。


12,纖維蛋白(fibrous protein):一類主要的不溶于水的蛋白質,通常都含有呈現相同二級結構的多肽鏈許多纖維蛋白結合緊密,并為 單個細胞或整個生物體提供機械強度,起著保護或結構上的作用。


13,球蛋白(globular protein):緊湊的,近似球形的,含有折疊緊密的多肽鏈的一類蛋白質,許多都溶于水。

典形的球蛋白含有能特異的識別其它化合物的凹陷或裂隙部位。


14,角蛋白(keratin):由處于α-螺旋或β-折疊構象的平行的多肽鏈組成不溶于水的起著保護或結構作用蛋白質。


15,膠原(蛋白)(collagen):是動物結締組織最豐富的一種蛋白質,它是由原膠原蛋白分子組成。

原膠原蛋白是一種具有右手超螺旋結構的蛋白。

每個原膠原分子都是由3條特殊的左手螺旋(螺距0.95 nm,每一圈含有3.3個殘基)的多肽鏈右手旋轉形成的。


16,疏水相互作用(hydrophobic interaction):非極性分子之間的一種弱的非共價的相互作用。

這些非極性的分子在水相環境中具有避開水而相互聚集的傾向。


17,伴娘蛋白(chaperone):與一種新合成的多肽鏈形成復合物并協助它正確折疊成具有生物功能構向的蛋白質。

伴娘蛋白可以防止不正確折疊中間體的形成和沒有組裝的蛋白亞基的不正確聚集,協助多肽鏈跨膜轉運以及大的多亞基蛋白質的組裝和解體。


18,二硫鍵(disulfide bond):通過兩個(半胱氨酸)巰基的氧化形成的共價鍵。

二硫鍵在穩定某些蛋白的三維結構上起著重要的作用。


19,范德華力(van der Waals force):中性原子之間通過瞬間靜電相互作用產生的一弱的分子之間的力。

當兩個原子之間的距離為它們范德華力半徑之和時,范德華力最強。強的范德華力的排斥作用可防止原子相互靠近。


20,蛋白質變性(denaturation):生物大分子的天然構象遭到破壞導致其生物活性喪失的現象。

蛋白質在受到光照,熱,有機溶濟以及一些變性濟的作用時,次級鍵受到破壞,導致天然構象的破壞,使蛋白質的生物活性喪失。


21,肌紅蛋白(myoglobin):是由一條肽鏈和一個血紅素輔基組成的結合蛋白,是肌肉內儲存氧的蛋白質,它的氧飽和曲線為雙曲線型。


22,復性(renaturation):在一定的條件下,變性的生物大分子恢復成具有生物活性的天然構象的現象。


23,波爾效應(Bohr effect):CO2濃度的增加降低細胞內的pH,引起紅細胞內血紅蛋白氧親和力下降的現象。


24,血紅蛋白(hemoglobin):是由含有血紅素輔基的4個亞基組成的結合蛋白。血紅蛋白負責將氧由肺運輸到外周組織,它的氧飽和曲線為S型。


25,別構效應(allosteric effect):又稱為變構效應,是寡聚蛋白與配基結合改變蛋白質的構象,導致蛋白質生物活性喪失的現象。


26,鐮刀型細胞貧血病(sickle-cell anemia): 血紅蛋白分子遺傳缺陷造成的一種疾病,病人的大部分紅細胞呈鐮刀狀。其特點是病人的血紅蛋白β-亞基N端的第六個氨基酸殘缺是纈氨酸(vol),而不是下正常的谷氨酸殘基(Ghe)。




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