16sDNA簡(jiǎn)介及其應(yīng)用于細(xì)菌鑒定的優(yōu)點(diǎn)
16S rDNA是細(xì)菌 的系統(tǒng)分類研究中最有用的和最常用的分子鐘,其種類少,含量大(約占細(xì)菌RNA含量的80%),分子大小適中,存在于所有的生物中,其進(jìn)化具有良好的時(shí)鐘性質(zhì),在結(jié)構(gòu)與功能上具有高度的保守性,素有“細(xì)菌化石”之稱。
在大多數(shù)原核生物中rDNA都具有多個(gè)拷貝,5S、16S、23S rDNA的拷貝數(shù)相同。16S rDNA由于大小適中,約1.5Kb左右,既能體現(xiàn)不同菌屬之間的差異,又能利用測(cè)序技術(shù)較容易地得到其序列,故被細(xì)菌學(xué)家和分類學(xué)家接受。
在細(xì)菌基因組 中, 編碼16S rRNA 的 rDNA 基因具有良好的進(jìn)化保守性, 適宜分析的長(zhǎng)度( 約為 1 5kb), 以及與進(jìn)化距離相匹配的良好變異性,所以成為細(xì)菌分子鑒定的標(biāo)準(zhǔn)標(biāo)識(shí)序列。目前 16SrDNA 的序列信息已經(jīng)廣泛應(yīng)用于菌種鑒定和系統(tǒng)發(fā)生學(xué)研究。那么,利用16SrDNA進(jìn)行細(xì)菌鑒定有哪些優(yōu)點(diǎn)呢?
1、16S rRNA 普遍存在于原核生物中。rRNA 參與生物蛋白質(zhì)的合成過(guò)程,其功能是任何生物都必不可少的,而且在生物進(jìn)化的漫長(zhǎng)歷程中保持不變,可看作為生物演變的時(shí)間鐘。
2、在 16S rRNA 分子中,既含有高度保守的序列區(qū)域,又有中度保守和高度變化的序列區(qū)域,因而它適用于進(jìn)化距離不同的各類生物親緣關(guān)系的研究。
3、16S rRNA 的相對(duì)分子量大小適中,約1540 個(gè)核苷酸,便于序列分析。
4、可變區(qū)序列因細(xì)菌不同而異,恒定區(qū)序列基本保守,所以可利用恒定區(qū)序列設(shè)計(jì)引物,將16S rDNA片段擴(kuò)增出來(lái),利用可變區(qū)序列的差異來(lái)對(duì)不同菌屬、菌種的細(xì)菌進(jìn)行分類鑒定。
由上可知,細(xì)菌核糖體16S小亞基基因(16SrDNA)鑒定擁有其他類似技術(shù)不能比擬的優(yōu)勢(shì),16S rDNA的潛力不容忽視,我們可以預(yù)見(jiàn),未來(lái)這一技術(shù)將在各個(gè)生物領(lǐng)域大有可為。


