平末端連接
T4DNA連接酶也能催化限制性內切酶切割產生DNA平末端的連接。如果目的序列和 載體 上沒有相同的限制性內切酶位點可供利用，用不同的限制性內切酶切割后的粘性末端不能互補結合，則可用適當的酶將DNA突出的末端削平或補齊成平末端，再用T4DNA連接酶連接，但平末端連接要比粘性末端連接的效率低得多。
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