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原位雜交(in situ hybridization)
發(fā)布日期:2022-11-08 08:28:23


原位雜交(in situ hybridization)


原位雜交(in situ hybridization)用特定標(biāo)記的已知堿基序列核酸作為探針與組織、細(xì)胞中待檢測(cè)核酸按堿基互補(bǔ)配對(duì)的原則在原位進(jìn)行特異性結(jié)合,形成雜交體,然后用與標(biāo)記物相應(yīng)的監(jiān)測(cè)系統(tǒng),通過(guò)免疫組織化學(xué)方法在被檢測(cè)核酸原位進(jìn)行細(xì)胞內(nèi)核酸定位。原位雜交可根據(jù)檢測(cè)物而分為細(xì)胞內(nèi)和組織切片原位雜交;根據(jù)其用探針及檢測(cè)核酸的不同可分為DNA-DNA、RNA-DNA、RNA-RNA雜交。根據(jù)標(biāo)記方法不同可分為放射性探針和非放射性探針。
其基本方法包括:固定、切片、雜交、顯色等主要步驟。


(一)取材與標(biāo)本固定
1. 取材 對(duì)于原位雜交所用的材料要盡可能新鮮,為了防止RNA的降解,取材要迅速,取材后要盡快固定或冷凍保存。


2. 固定 進(jìn)行原位雜交的組織或細(xì)胞必須經(jīng)過(guò)固定處理,固定的目的是為了

①保持細(xì)胞形態(tài)原有結(jié)構(gòu);

②最大限度保存細(xì)胞內(nèi)的DNA或RNA的水平;

③使探針易于進(jìn)入細(xì)胞或組織內(nèi)。


3. 固定液 常用固定液有10%甲醛、4%多聚甲醛、冰醋酸-酒精混合液、Bouin氏固定液等。這些固定液都有不同的優(yōu)缺點(diǎn)因此要根據(jù)具體的實(shí)驗(yàn)對(duì)象,選擇最佳的固定液。


4. 固定方法 組織標(biāo)本取材后,迅速放入固定液中2~4h,取材組織大小為1cm×1cm×0.5cm,不宜太大。必要時(shí),動(dòng)物組織可進(jìn)行灌流固定,然后將組織按要求取材放入20%蔗糖中,4℃過(guò)夜,次日可行冰凍切片。


(二)切片及細(xì)胞標(biāo)本的制備
1. 載玻片的處理 因?yàn)樵浑s交一般在載玻片上進(jìn)行,所以載玻片必須保持清潔且不能有任何核酸酶的污染。一般載玻片可先經(jīng)洗衣粉浸泡過(guò)夜,用流水沖洗、酸中浸泡4~8h,再用流水沖洗,雙蒸水洗2~3次。在160℃烤箱中烘烤2~4h。亦可經(jīng)15磅高壓滅菌20min處理,可將載玻片上的核酸酶消除。


2. 組織切片與預(yù)處理
(1)冰凍切片:新鮮組織也可在取材后,直接置入液氮中迅速驟冷,冷凍切片后,4%多聚甲醛固定5~10min,也可保存在-70℃中待用。雜交前切片迅速恢復(fù)至室溫并干燥,0.1mol PBS洗三次,2×SSC洗10min,滴加預(yù)雜交液室溫孵育1h。


(2)石蠟切片:組織固定后,常規(guī)石蠟包埋切片,可長(zhǎng)期保存,隨時(shí)用于原位雜交。雜交前切片經(jīng)①二甲苯脫蠟2次,每次10min;

②純酒精洗2次,每次5min;

③空氣干燥5min;

④梯度酒精復(fù)洗95%,80%,70%各1min;

⑤0.1 mol PBS洗3次,每次5min;

⑥2×SSC洗10min;

⑦滴加預(yù)雜交液于濕盒內(nèi)室溫孵育1h。


(3)培養(yǎng)細(xì)胞:每張載玻片滴加200μl濃度為1×105/m1的細(xì)胞懸浮液,空氣干燥1~2min制成細(xì)胞涂片,也可直接用培養(yǎng)細(xì)胞蓋片。上述細(xì)胞片經(jīng)酒精或多聚甲醛固定5min,其余步驟同冰凍切片。


(三) 試劑 配制
配制溶液過(guò)程中均需戴手套,液體配制均用超凈水,所用瓶子均經(jīng)160℃烘烤4h,主要目的是去除RNA酶。
1. DEPC水 將DEPC按1‰濃度加入超凈水中,充分混合后靜置過(guò)夜,15~20min高壓消毒,之后室溫避塵存放。


2. 0.1mol PBS pH 7.4
A液:0.1mol NaH2PO4為NaH2PO4 (MW:156.01,2H2O) 1.56g;DEPC水 100.00m1。
B液:0.1mol Na2HP04為Na2HPO4 (MW:358.14,12H2O) 17.907g;DEPC水 500.00m1。
A液:B液=9.5∶40.5 加NaCl使其濃度達(dá)0.85%。


3. 20×SSC 為NaCl(3mol/L) 8.765g;Na3C6H50H2O7·2(0.3mol/L) 4.410g;DEPC水50.00m1。

4. 4%多聚甲醛(pH 7.4) 為多聚甲醛4g;0.1mol PBS 100m1。


5. 緩沖液
(1) 緩沖液Ⅰ(pH 7.5) 為1mol Tris-HCl 100ml;5mol NaCl 20ml;消毒超凈水加至1000ml。
(2) 緩沖液Ⅱ(pH 9.5) 為1mol Tris-HCl 100ml;5mol NaCl 20ml;1molMgCI 50ml;消毒超凈水加至1000ml。
(3) 緩沖液 Ⅲ(pH 9.5) 為1mol Tris-HCl 100ml;1molEDTA 5ml;5mol NaCl 20ml;1molMgCI 50ml;消毒超凈水加至1000ml。



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